Die Hauptarbeitsfelder des Ev. Johanneswerks sind die Altenhilfe, die Eingliederungshilfe und Spezial- Kliniken, vor allem für seelische und psychosomatische Erkrankungen.

Die Altenhilfe umfasst 37 stationäre Einrichtungen sowie Kurzzeit- und Tagespflegeeinrichtungen in ganz Nordrhein-Westfalen und schließt ambulante Pflegedienste, Wohnprojekte und  Begegnungszentren ein. Mehr als 3.800 Mitarbeiter*innen pflegen, betreuen und begleiten tagtäglich mehr als 4.000 alte Menschen. Ein besonderes Augenmerk des Ev. Johanneswerks liegt auf den Herausforderungen der Zukunft, auf der demografische Entwicklung und modernen Wohnformen.

Der räumliche Schwerpunkt der Eingliederungshilfe liegt im Ruhrgebiet und im Märkischen Kreis. In sechs Wohnverbünden mit vielen individuell kombinierbaren Angeboten assistieren und begleiten die Mitarbeiter*innen hier rund 1.500 Kinder, Jugendliche und Erwachsene mit Beeinträchtigung. Ziel ist, deren Rechte und die Teilhabe am gesellschaftlichen Leben einzufordern, zu verteidigen und zu unterstützen. Hinzu kommt Studjo, eine diakonische Einrichtung für berufliche Rehabilitation für Menschen mit einer psychischen, geistigen und körperlichen Beeinträchtigung (WfbM), an insgesamt sieben Standorten. Hier beschäftigt das Werk über 1.100 Menschen mit Beeinträchtigung und bietet zahlreiche Arbeits- und Berufsbildungsmöglichkeiten. Im Mittelpunkt der Arbeit steht die Eingliederung der Menschen in das Arbeitsleben – und damit auch in die Gesellschaft.

Darüber hinaus gehören zum Johanneswerk zwei Kliniken mit angeschlossenen Tageskliniken für Psychosomatische Medizin, Psychotherapie und Psychiatrie sowie eine forensische Klinik.

Weitere kleinere Angebote im Werk und in seinen Tochtergesellschaften ergänzen das Hilfsangebot.